自2009年5月1日起，歐盟商標局(OHIM)調整歐盟商標(CTM)申請規費，並廢除原商標申請獲準後即須繳交之註冊費。此次調降係因歐盟商標局之自動化及申請件數超乎預期，而其及盈餘已累積達三億歐元。
亦即，2009年5月1日前，向歐盟商標局電子申請商標(1~3類)，原應繳申請規費750歐元申請費，獲準註冊後應再繳850歐元。然歐盟商標局(OHIM)自2009年5月1日起廢止原申請歐盟商標獲準後所須繳交之註冊費。因此，自今(2009)年5月1日起，電子申請歐盟商標(1~3類)僅須繳納申請費900歐元(未計入代理人費用)。易言之，商標申請註冊之規費共計減少700歐元。
在歐盟商標局成立之前，欲保護商標者原本必須在各國分別申請，自歐盟商標局成立以來，已不必分別向多國申請。在歐盟申請案提出後，歐盟商標局先審查形式要件及識別性等絶對要件。其後將與先申請案之衝突等相對要件委由各會員國(法國、德國、義大利、塞普勒斯、斯洛維亞、馬爾他除外)檢索後，由各會員國報告給歐盟商標局，通知申請人為必要處置。除分別由歐盟商標局與各國商標局在分擔商標審查作業外，歐盟商標制度與世界其他各國大致相同，亦有異議、評定、廢止等「公眾審查制度」。
目前在歐盟商標局所為之單一註冊，其効力可及於奧地利、比利時、丹麥、芬蘭、法國、德國、希臘、義大利、愛爾蘭、盧森堡、荷蘭、西班牙、瑞典、葡萄牙、英國、捷克、愛沙尼亞、賽普勒斯、拉脫維亞、立陶宛、匈牙利、馬爾他、波蘭、斯洛文尼亞、斯洛伐克、保加利亞等27個歐盟會員國。
| 申請種類 | 舊規費(歐元) | 新規費(歐元) |
|---|---|---|
| 歐盟商標(CTM)申請費(紙本申請) | 900 | 1,050 |
| 歐盟商標(CTM)申請費(電子申請) | 750 | 900 |
| 歐盟團體標章申請費 | 1,300 | 1,800 |
| 歐盟註冊費 | 850 | 0 |
